TY - JOUR AU - Gillet, N. AU - Florins, A. AU - Boxus, M. AU - Burteau, C. AU - Nigro, A. AU - Vandermeers, F. AU - Balon, H. AU - Bouzar, A. -. B. AU - Defoiche, J. AU - Burny, A. AU - Reichert, M. AU - Kettmann, R. AU - Willems, L. PY - 2007 DA - 2007// TI - Mechanisms of leukemogenesis induced by bovine leukemia virus: prospects for novel anti-retroviral therapies in human JO - Retrovirology VL - 4 UR - https://doi.org/10.1186/1742-4690-4-18 DO - 10.1186/1742-4690-4-18 ID - Gillet2007 ER - TY - JOUR AU - Ishitsuka, K. AU - Tamura, K. PY - 2014 DA - 2014// TI - Human T-cell leukaemia virus type I and adult T-cell leukaemia-lymphoma JO - Lancet Oncol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/S1470-2045(14)70202-5 DO - 10.1016/S1470-2045(14)70202-5 ID - Ishitsuka2014 ER - TY - STD TI - Burny A, Willems L, Callebaut I, Adam E, Cludts I, Dequiedt F, Droogmans L, Grimonpont C, Kerkhofs P, Mammerickx M. Bovine leukemia virus: biology and mode of transformation. In: Minson AC, Neil JC, McRae, MA, editors. Viruses and cancer. Cambridge: Cambridge University Press; 1994. p. 213–34. ID - ref3 ER - TY - JOUR AU - Rodriguez, S. M. AU - Florins, A. AU - Gillet, N. AU - Brogniez, A. AU - Sánchez-Alcaraz, M. T. AU - Boxus, M. AU - Boulanger, F. AU - Gutiérrez, G. AU - Trono, K. AU - Alvarez, I. AU - Vagnoni, L. AU - Willems, L. PY - 2011 DA - 2011// TI - Preventive and therapeutic strategies for bovine leukemia virus: lessons for HTLV JO - Viruses VL - 3 UR - https://doi.org/10.3390/v3071210 DO - 10.3390/v3071210 ID - Rodriguez2011 ER - TY - JOUR AU - Gillet, N. A. AU - Gutiérrez, G. AU - Rodriguez, S. M. AU - Brogniez, A. AU - Renotte, N. AU - Alvarez, I. AU - Trono, K. AU - Willems, L. PY - 2013 DA - 2013// TI - Massive depletion of bovine leukemia virus proviral clones located in genomic transcriptionally active sites during primary infection JO - PLoS Pathog VL - 9 UR - https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1003687 DO - 10.1371/journal.ppat.1003687 ID - Gillet2013 ER - TY - JOUR AU - Grassmann, R. AU - Aboud, M. AU - Jeang, K. -. T. PY - 2005 DA - 2005// TI - Molecular mechanisms of cellular transformation by HTLV-1 Tax JO - Oncogene VL - 24 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1208978 DO - 10.1038/sj.onc.1208978 ID - Grassmann2005 ER - TY - JOUR AU - Cook, L. B. AU - Elemans, M. AU - Rowan, A. G. AU - Asquith, B. PY - 2013 DA - 2013// TI - HTLV-1: persistence and pathogenesis JO - Virology VL - 435 UR - https://doi.org/10.1016/j.virol.2012.09.028 DO - 10.1016/j.virol.2012.09.028 ID - Cook2013 ER - TY - JOUR AU - Merimi, M. AU - Klener, P. AU - Szynal, M. AU - Cleuter, Y. AU - Kerkhofs, P. AU - Burny, A. AU - Martiat, P. AU - Broeke, A. PY - 2007 DA - 2007// TI - Suppression of viral gene expression in bovine leukemia virus-associated B-cell malignancy: interplay of epigenetic modifications leading to chromatin with a repressive histone code JO - J Virol VL - 81 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.02606-06 DO - 10.1128/JVI.02606-06 ID - Merimi2007 ER - TY - JOUR AU - Kataoka, K. AU - Nagata, Y. AU - Kitanaka, A. AU - Shiraishi, Y. AU - Shimamura, T. AU - Yasunaga, J. -. I. AU - Totoki, Y. AU - Chiba, K. AU - Sato-Otsubo, A. AU - Nagae, G. AU - Ishii, R. AU - Muto, S. AU - Kotani, S. AU - Watatani, Y. AU - Takeda, J. AU - Sanada, M. AU - Tanaka, H. AU - Suzuki, H. AU - Sato, Y. AU - Shiozawa, Y. AU - Yoshizato, T. AU - Yoshida, K. AU - Makishima, H. AU - Iwanaga, M. AU - Ma, G. AU - Nosaka, K. AU - Hishizawa, M. AU - Itonaga, H. AU - Imaizumi, Y. AU - Munakata, W. PY - 2015 DA - 2015// TI - Integrated molecular analysis of adult T cell leukemia/lymphoma JO - Nat Genet VL - 47 UR - https://doi.org/10.1038/ng.3415 DO - 10.1038/ng.3415 ID - Kataoka2015 ER - TY - JOUR AU - Gaudray, G. AU - Gachon, F. AU - Basbous, J. AU - Biard-Piechaczyk, M. AU - Devaux, C. AU - Mesnard, J. M. PY - 2002 DA - 2002// TI - The complementary strand of the human T-cell leukemia virus type 1 RNA genome encodes a bZIP transcription factor that down-regulates viral transcription JO - J Virol VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.76.24.12813-12822.2002 DO - 10.1128/JVI.76.24.12813-12822.2002 ID - Gaudray2002 ER - TY - JOUR AU - Satou, Y. AU - Yasunaga, J. -. I. AU - Yoshida, M. AU - Matsuoka, M. PY - 2006 DA - 2006// TI - HTLV-I basic leucine zipper factor gene mRNA supports proliferation of adult T cell leukemia cells JO - Proc Natl Acad Sci VL - 103 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.0507631103 DO - 10.1073/pnas.0507631103 ID - Satou2006 ER - TY - STD TI - Mitobe Y, Yasunaga JI, Furuta R, Matsuoka M. HTLV-1 bZIP factor RNA and protein impart distinct functions on T-cell proliferation and survival. Cancer Res. 2015;75:1–11. ID - ref12 ER - TY - JOUR AU - Rosewick, N. AU - Momont, M. AU - Durkin, K. AU - Takeda, H. AU - Caiment, F. AU - Cleuter, Y. AU - Vernin, C. AU - Mortreux, F. AU - Wattel, É. AU - Burny, A. AU - Georges, M. AU - Broeke, A. PY - 2013 DA - 2013// TI - Deep sequencing reveals abundant noncanonical retroviral microRNAs in B-cell leukemia/lymphoma JO - Proc Natl Acad Sci VL - 110 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1213842110 DO - 10.1073/pnas.1213842110 ID - Rosewick2013 ER - TY - JOUR AU - Kincaid, R. P. AU - Burke, J. M. AU - Sullivan, C. S. PY - 2012 DA - 2012// TI - RNA virus microRNA that mimics a B-cell oncomiR JO - Proc Natl Acad Sci VL - 109 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.1116107109 DO - 10.1073/pnas.1116107109 ID - Kincaid2012 ER - TY - JOUR AU - Colin, L. AU - Dekoninck, A. AU - Reichert, M. AU - Calao, M. AU - Merimi, M. AU - Broeke, A. AU - Vierendeel, V. AU - Cleuter, Y. AU - Burny, A. AU - Rohr, O. AU - Lint, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Chromatin disruption in the promoter of bovine leukemia virus during transcriptional activation JO - Nucleic Acids Res VL - 39 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkr671 DO - 10.1093/nar/gkr671 ID - Colin2011 ER - TY - JOUR AU - Pierard, V. AU - Guiguen, A. AU - Colin, L. AU - Wijmeersch, G. AU - Vanhulle, C. AU - Driessche, B. AU - Dekoninck, A. AU - Blazkova, J. AU - Cardona, C. AU - Merimi, M. AU - Vierendeel, V. AU - Calomme, C. AU - Nguyên, T. L. -. A. AU - Nuttinck, M. AU - Twizere, J. -. C. AU - Kettmann, R. AU - Portetelle, D. AU - Burny, A. AU - Hirsch, I. AU - Rohr, O. AU - Lint, C. PY - 2010 DA - 2010// TI - DNA cytosine methylation in the bovine leukemia virus promoter is associated with latency in a lymphoma-derived B-cell line: potential involvement of direct inhibition of cAMP-responsive element (CRE)-binding protein/CRE modulator/activation transcription factor binding JO - J Biol Chem VL - 285 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M110.107607 DO - 10.1074/jbc.M110.107607 ID - Pierard2010 ER - TY - JOUR AU - Kiermer, V. AU - Lint, C. AU - Briclet, D. AU - Vanhulle, C. AU - Kettmann, R. AU - Verdin, E. AU - Burny, A. AU - Droogmans, L. PY - 1998 DA - 1998// TI - An interferon regulatory factor binding site in the U5 region of the bovine leukemia virus long terminal repeat stimulates tax-independent gene expression JO - J Virol VL - 72 ID - Kiermer1998 ER - TY - JOUR AU - Calomme, C. AU - Nguyên, T. L. -. A. AU - Launoit, Y. AU - Kiermer, V. AU - Droogmans, L. AU - Burny, A. AU - Lint, C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Upstream stimulatory factors binding to an E box motif in the R region of the bovine leukemia virus long terminal repeat stimulates viral gene expression JO - Journal of Biological Chemistry VL - 277 UR - https://doi.org/10.1074/jbc.M107441200 DO - 10.1074/jbc.M107441200 ID - Calomme2002 ER - TY - JOUR AU - Wang, L. AU - Park, H. J. AU - Dasari, S. AU - Wang, S. AU - Kocher, J. P. AU - Li, W. PY - 2013 DA - 2013// TI - CPAT: Coding-Potential Assessment Tool using an alignment-free logistic regression model JO - Nucleic Acids Res VL - 41 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkt006 DO - 10.1093/nar/gkt006 ID - Wang2013 ER - TY - STD TI - Finn RD, Bateman A, Clements J, Coggill P, Eberhardt RY, Eddy SR, Heger A, Hetherington K, Holm L, Mistry J, Sonnhammer ELL, Tate J, Punta M. Pfam: the protein families database. Nucleic Acids Res. 2014;42(database issue):D222–30. ID - ref20 ER - TY - JOUR AU - Mattick, J. S. AU - Rinn, J. L. PY - 2015 DA - 2015// TI - Discovery and annotation of long noncoding RNAs JO - Nat Struct Mol Biol VL - 22 UR - https://doi.org/10.1038/nsmb.2942 DO - 10.1038/nsmb.2942 ID - Mattick2015 ER - TY - JOUR AU - Davis, E. AU - Caiment, F. AU - Tordoir, X. AU - Cavaillé, J. AU - Ferguson-Smith, A. AU - Cockett, N. AU - Georges, M. AU - Charlier, C. PY - 2005 DA - 2005// TI - RNAi-Mediated Allelic trans-Interaction at the Imprinted Rtl1/Peg11 Locus JO - Curr Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1016/j.cub.2005.02.060 DO - 10.1016/j.cub.2005.02.060 ID - Davis2005 ER - TY - JOUR AU - Cook, L. B. M. AU - Melamed, A. AU - Demontis, M. A. AU - Laydon, D. J. AU - Fox, J. M. AU - Tosswill, J. H. C. AU - Freitas, D. AU - Price, A. D. AU - Medcalf, J. F. AU - Martin, F. AU - Neuberger, J. M. AU - Bangham, C. R. M. AU - Taylor, G. P. PY - 2016 DA - 2016// TI - Rapid dissemination of human T-lymphotropic virus type 1 during primary infection in transplant recipients JO - Retrovirology VL - 13 UR - https://doi.org/10.1186/s12977-015-0236-7 DO - 10.1186/s12977-015-0236-7 ID - Cook2016 ER - TY - JOUR AU - Calomme, C. AU - Dekoninck, A. AU - Nizet, S. AU - Adam, E. AU - Nguyen, T. L. A. AU - Broeke, A. AU - Willems, L. AU - Kettmann, R. AU - Burny, A. AU - Lint, C. PY - 2004 DA - 2004// TI - Overlapping CRE and E Box motifs in the enhancer sequences of the Bovine Leukemia Virus 5′ long terminal repeat are critical for basal and acetylation-dependent transcriptional activity of the viral promoter: implications for viral latency JO - J Virol VL - 78 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.78.24.13848-13864.2004 DO - 10.1128/JVI.78.24.13848-13864.2004 ID - Calomme2004 ER - TY - STD TI - Van Driessche B, Rodari A, Delacourt N, Fauquenoy S, Vanhulle C, Burny A, Rohr O, Van Lint C. Characterization of new RNA polymerase III and RNA polymerase II transcriptional promoters in the Bovine Leukemia Virus genome. bioRxiv. 2016. doi:10.1101/043034. ID - ref25 ER - TY - JOUR AU - Hutvagner, G. AU - Simard, M. J. PY - 2008 DA - 2008// TI - Argonaute proteins: key players in RNA silencing JO - Nat Rev Mol Cell Biol VL - 9 UR - https://doi.org/10.1038/nrm2321 DO - 10.1038/nrm2321 ID - Hutvagner2008 ER - TY - JOUR AU - Sullivan, C. S. AU - Grundhoff, A. T. AU - Tevethia, S. AU - Pipas, J. M. AU - Ganem, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - SV40-encoded microRNAs regulate viral gene expression and reduce susceptibility to cytotoxic T cells JO - Nature VL - 435 UR - https://doi.org/10.1038/nature03576 DO - 10.1038/nature03576 ID - Sullivan2005 ER - TY - JOUR AU - Barth, S. AU - Pfuhl, T. AU - Mamiani, A. AU - Ehses, C. AU - Roemer, K. AU - Kremmer, E. AU - Jäker, C. AU - Höck, J. AU - Meister, G. AU - Grässer, F. A. PY - 2008 DA - 2008// TI - Epstein-Barr virus-encoded microRNA miR-BART2 down-regulates the viral DNA polymerase BALF5 JO - Nucleic Acids Res VL - 36 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkm1080 DO - 10.1093/nar/gkm1080 ID - Barth2008 ER - TY - JOUR AU - Cox, J. E. AU - Sullivan, C. S. PY - 2014 DA - 2014// TI - Balance and Stealth: the role of noncoding RNAs in the regulation of virus gene expression JO - Ann Rev Virol VL - 1 UR - https://doi.org/10.1146/annurev-virology-031413-085439 DO - 10.1146/annurev-virology-031413-085439 ID - Cox2014 ER - TY - JOUR AU - Moir, R. D. AU - Willis, I. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Regulation of pol III transcription by nutrient and stress signaling pathways JO - BBA Gene Regul Mech VL - 1829 ID - Moir2013 ER - TY - JOUR AU - Barbeau, B. AU - Péloponèse, J. -. M. AU - Mesnard, J. -. M. PY - 2013 DA - 2013// TI - Functional comparison of antisense proteins of HTLV-1 and HTLV-2 in viral pathogenesis JO - Front Microbiol VL - 4 UR - https://doi.org/10.3389/fmicb.2013.00226 DO - 10.3389/fmicb.2013.00226 ID - Barbeau2013 ER - TY - JOUR AU - Rende, F. AU - Cavallari, I. AU - Corradin, A. AU - Silic-Benussi, M. AU - Toulza, F. AU - Toffolo, G. M. AU - Tanaka, Y. AU - Jacobson, S. AU - Taylor, G. P. AU - D’Agostino, D. M. AU - Bangham, C. R. M. AU - Ciminale, V. PY - 2011 DA - 2011// TI - Kinetics and intracellular compartmentalization of HTLV-1 gene expression: nuclear retention of HBZ mRNAs JO - Blood VL - 117 UR - https://doi.org/10.1182/blood-2010-11-316463 DO - 10.1182/blood-2010-11-316463 ID - Rende2011 ER - TY - JOUR AU - Iyer, M. K. AU - Niknafs, Y. S. AU - Malik, R. AU - Singhal, U. AU - Sahu, A. AU - Hosono, Y. AU - Barrette, T. R. AU - Prensner, J. R. AU - Evans, J. R. AU - Zhao, S. AU - Poliakov, A. AU - Cao, X. AU - Dhanasekaran, S. M. AU - Wu, Y. -. M. AU - Robinson, D. R. AU - Beer, D. G. AU - Feng, F. Y. AU - Iyer, H. K. AU - Chinnaiyan, A. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - The landscape of long noncoding RNAs in the human transcriptome JO - Nat Genet VL - 47 UR - https://doi.org/10.1038/ng.3192 DO - 10.1038/ng.3192 ID - Iyer2015 ER - TY - JOUR AU - Vance, K. W. AU - Ponting, C. P. PY - 2014 DA - 2014// TI - Transcriptional regulatory functions of nuclear long noncoding RNAs JO - Trends Genet VL - 30 UR - https://doi.org/10.1016/j.tig.2014.06.001 DO - 10.1016/j.tig.2014.06.001 ID - Vance2014 ER - TY - JOUR AU - Pauli, A. AU - Valen, E. AU - Schier, A. F. PY - 2014 DA - 2014// TI - Identifying (non-)coding RNAs and small peptides: challenges and opportunities JO - BioEssays VL - 37 UR - https://doi.org/10.1002/bies.201400103 DO - 10.1002/bies.201400103 ID - Pauli2014 ER - TY - JOUR AU - Willems, L. AU - Kettmann, R. AU - Dequiedt, F. AU - Portetelle, D. AU - Vonèche, V. AU - Cornil, I. AU - Kerkhofs, P. AU - Burny, A. AU - Mammerickx, M. PY - 1993 DA - 1993// TI - In vivo infection of sheep by bovine leukemia virus mutants JO - J Virol VL - 67 ID - Willems1993 ER - TY - JOUR AU - Weil, D. AU - Boutain, S. AU - Audibert, A. AU - Dautry, F. PY - 2000 DA - 2000// TI - Mature mRNAs accumulated in the nucleus are neither the molecules in transit to the cytoplasm nor constitute a stockpile for gene expression JO - RNA VL - 6 UR - https://doi.org/10.1017/S1355838200000479 DO - 10.1017/S1355838200000479 ID - Weil2000 ER - TY - JOUR AU - Stein, C. A. AU - Hansen, J. B. AU - Lai, J. AU - Wu, S. AU - Voskresenskiy, A. AU - Høg, A. AU - Worm, J. AU - Hedtjärn, M. AU - Souleimanian, N. AU - Miller, P. AU - Soifer, H. S. AU - Castanotto, D. AU - Benimetskaya, L. AU - Ørum, H. AU - Koch, T. PY - 2010 DA - 2010// TI - Efficient gene silencing by delivery of locked nucleic acid antisense oligonucleotides, unassisted by transfection reagents JO - Nucleic Acids Res VL - 38 UR - https://doi.org/10.1093/nar/gkp841 DO - 10.1093/nar/gkp841 ID - Stein2010 ER - TY - JOUR AU - Broeke, A. AU - Bagnis, C. AU - Ciesiolka, M. AU - Cleuter, Y. AU - Gelderblom, H. AU - Kerkhofs, P. AU - Griebel, P. AU - Mannoni, P. AU - Burny, A. PY - 1999 DA - 1999// TI - In vivo rescue of a silent tax-deficient bovine leukemia virus from a tumor-derived ovine B-cell line by recombination with a retrovirally transduced wild-type tax gene JO - J Virol VL - 73 ID - Broeke1999 ER -