Skip to main content

Table 3 The comparison results of four cattle samples for a peptide microarray

From: Identification and characterization of common B cell epitope in bovine leukemia virus via high-throughput peptide screening system in infected cattle

No.

Peptide sequence

Cattleb no.

No.

Peptide sequence

Cattleb no.

No.

Peptide sequence

Cattleb no.

JB

JB

JB

S4

S6

N1

N2

S4

S6

N1

N2

S4

S6

N1

N2

p15a

     

p24a

     

gp51a

     

1

MGNSPSYNPPAGISP

−

+

+

−

28

DLRSQYQNLWLQAWK

−

+

−

−

12

RYTLDSVNGYPKIYW

−

−

−

+

2

PSYNPPAGISPSDWL

−

−

+

−

29

QYQNLWLQAWKNLPT

−

−

−

−

13

DSVNGYPKIYWPPPQ

−

−

−

−

3

PPAGISPSDWLNLVQ

−

−

−

−

30

LWLQAWKNLPTRPSV

−

−

−

−

14

GYPKIYWPPPQGRRR

−

+

−

−

4

ISPSDWLNLVQSAQR

+

−

−

−

31

AWKNLPTRPSVQPWS

−

−

−

−

15

IYWPPPQGRRRFGAR

+

+

+

−

5

DWLNLVQSAQRLNPR

−

−

−

+

32

LPTRPSVQPWSTIVQ

+

−

−

−

16

PPQGRRRFGARAMVT

+

+

+

+

6

LVQSAQRLNPRPSPS

−

−

−

−

33

PSVQPWSTIVQGPAE

−

−

+

−

17

RRRFGARAMVTYDCE

−

+

+

+

7

AQRLNPRPSPSDFTD

−

−

−

−

34

PWSTIVQGPAESYVE

−

−

−

−

18

GARAMVTYDCEPRCP

+

−

−

−

8

NPRPSPSDFTDLKNY

−

−

−

−

35

IVQGPAESYVEFVNR

−

−

−

−

19

MVTYDCEPRCPYVGA

−

−

−

−

9

SPSDFTDLKNYIHWF

−

−

−

+

36

PAESYVEFVNRLQIS

−

+

−

−

20

DCEPRCPYVGADRFD

−

−

−

−

10

FTDLKNYIHWFHKTQ

−

−

−

+

37

YVEFVNRLQISLADN

−

−

−

−

21

RCPYVGADRFDCPHW

−

−

−

−

11

KNYIHWFHKTQKKPW

−

−

−

−

38

VNRLQISLADNLPDG

−

+

−

−

22

VGADRFDCPHWDNAS

−

−

−

−

12

HWFHKTQKKPWTFTS

−

−

−

−

39

QISLADNLPDGVPKE

−

+

+

+

23

RFDCPHWDNASQADQ

−

−

−

−

13

KTQKKPWTFTSGGPT

−

−

−

−

40

ADNLPDGVPKEPIID

−

−

+

−

24

PHWDNASQADQGSFY

−

−

−

−

14

KPWTFTSGGPTSCPP

−

−

−

−

41

PDGVPKEPIIDSLSY

−

−

−

−

25

NASQADQGSFYVNHQ

−

−

−

−

15

FTSGGPTSCPPGRFG

−

−

−

−

42

PKEPIIDSLSYANAN

−

−

+

−

26

ADQGSFYVNHQILFL

−

−

−

−

16

GPTSCPPGRFGRVPL

−

−

−

−

43

IIDSLSYANANKECQ

−

−

+

−

27

SFYVNHQILFLHLKQ

−

−

−

−

17

CPPGRFGRVPLVLAT

−

−

−

−

44

LSYANANKECQQILQ

−

−

+

−

28

NHQILFLHLKQCHGI

−

−

−

−

18

RFGRVPLVLATLNEV

−

−

−

+

45

NANKECQQILQGRGL

−

−

+

−

29

LFLHLKQCHGIFTLT

−

−

−

−

19

VPLVLATLNEVLSNE

−

−

−

−

46

ECQQILQGRGLVAAP

−

−

−

−

30

LKQCHGIFTLTWEIW

−

−

+

−

20

LATLNEVLSNEGGAP

−

+

+

−

47

ILQGRGLVAAPVGQK

−

+

−

−

31

HGIFTLTWEIWGYDP

−

+

+

−

21

NEVLSNEGGAPGASA

−

−

−

−

48

RGLVAAPVGQKLQAC

−

−

−

−

32

TLTWEIWGYDPLITF

−

−

+

+

22

SNEGGAPGASAPEEQ

−

−

−

−

49

AAPVGQKLQACAHWA

−

−

−

−

33

EIWGYDPLITFSLHK

−

−

−

−

23

GAPGASAPEEQPPPY

−

−

+

−

50

GQKLQACAHWAPKMK

−

−

−

−

34

YDPLITFSLHKIPDP

−

−

+

−

24

ASAPEEQPPPYDPPA

−

−

−

−

51

QACAHWAPKMKQPAI

−

−

−

−

35

ITFSLHKIPDPPQPD

−

+

−

−

25

EEQPPPYDPPAI

−

−

+

−

52

HWAPKMKQPAIL

−

−

−

−

36

LHKIPDPPQPDFPQL

−

−

−

−

p24a

     

p12a

     

37

PDPPQPDFPQLNSDW

−

−

+

−

          

38

QPDFPQLNSDWVPSV

−

−

−

−

1

LPIISEGNRNRHRAW

+

−

+

−

1

VHTPGPKMPGPRQPA

+

+

+

−

39

PQLNSDWVPSVRSWA

−

−

−

−

2

SEGNRNRHRAWALRE

+

−

+

−

2

GPKMPGPRQPAPKRP

−

−

−

−

40

SDWVPSVRSWALLLN

−

+

+

−

3

RNRHRAWALRELQDI

+

+

+

−

3

PGPRQPAPKRPPPGP

−

−

−

−

41

PSVRSWALLLNQTAR

−

−

−

−

4

RAWALRELQDIKKEI

+

+

+

−

4

QPAPKRPPPGPCYRC

−

−

−

−

42

SWALLLNQTARAFPD

−

−

+

−

5

LRELQDIKKEIENKA

+

+

+

−

5

KRPPPGPCYRCLKEG

−

−

−

−

43

LLNQTARAFPDCAIC

−

−

−

−

6

QDIKKEIENKAPGSQ

+

−

+

−

6

PGPCYRCLKEGHWAR

−

−

−

−

44

TARAFPDCAICWEPS

−

−

−

−

7

KEIENKAPGSQVWIQ

+

−

+

−

7

YRCLKEGHWARDCPT

−

−

−

−

45

FPDCAICWEPSPPWA

−

−

−

−

8

NKAPGSQVWIQTLRL

−

−

+

−

8

KEGHWARDCPTKATG

−

+

+

+

46

AICWEPSPPWAPEIL

−

−

−

−

9

GSQVWIQTLRLAILQ

−

−

−

−

9

WARDCPTKATGPPPG

−

+

+

+

47

EPSPPWAPEILVYNK

−

−

−

−

10

WIQTLRLAILQADPT

−

−

−

−

10

CPTKATGPPPGPCPI

+

−

+

−

48

PWAPEILVYNKTISS

−

−

−

−

11

LRLAILQADPTPADL

+

−

−

−

11

ATGPPPGPCPICKDP

−

−

−

−

49

EILVYNKTISSSGPG

−

−

−

−

12

ILQADPTPADLEQLC

+

−

−

−

12

PPGPCPICKDPSHWK

+

+

+

−

50

YNKTISSSGPGLALP

−

−

−

−

13

DPTPADLEQLCQYIA

+

−

−

−

13

CPICKDPSHWKRDCP

−

−

−

−

51

ISSSGPGLALPDAQI

−

−

−

−

14

ADLEQLCQYIASPVD

−

−

+

−

14

KDPSHWKRDCPTLKS

−

+

+

−

52

GPGLALPDAQIFWVN

−

+

−

+

15

QLCQYIASPVDQTAH

+

−

+

−

gp51a

     

53

ALPDAQIFWVNTSSF

−

−

−

−

16

YIASPVDQTAHMTSL

−

−

+

−

     

54

AQIFWVNTSSFNTTQ

−

−

+

−

17

PVDQTAHMTSLTAAI

−

−

−

−

1

TWRCSLSLGNQQWMT

−

−

−

−

55

WVNTSSFNTTQGWHH

−

−

−

−

18

TAHMTSLTAAIAAAE

−

−

−

−

2

SLSLGNQQWMTAYNQ

−

−

−

−

56

SSFNTTQGWHHPSQR

−

−

+

−

19

TSLTAAIAAAEAANT

+

−

+

−

3

GNQQWMTAYNQEAKF

−

−

−

−

57

TTQGWHHPSQRLLFN

−

−

+

−

20

AAIAAAEAANTLQGF

−

−

−

−

4

WMTAYNQEAKFSISI

−

−

+

−

58

WHHPSQRLLFNVSQG

−

−

−

−

21

AAEAANTLQGFNPQN

−

−

+

−

5

YNQEAKFSISIDQIL

−

−

−

−

59

SQRLLFNVSQGNALL

−

−

−

−

22

ANTLQGFNPQNGTLT

−

−

−

+

6

AKFSISIDQILEAHN

−

−

+

−

60

LFNVSQGNALLLPPI

−

−

+

−

23

QGFNPQNGTLTQQSA

−

−

+

−

7

ISIDQILEAHNQSPF

−

−

+

−

61

SQGNALLLPPISLVN

−

−

+

−

24

PQNGTLTQQSAQPNA

−

−

+

−

8

QILEAHNQSPFCAKS

+

−

−

−

62

ALLLPPISLVNLSTA

−

−

+

−

25

TLTQQSAQPNAGDLR

−

−

+

−

9

AHNQSPFCAKSPRYT

−

−

−

−

63

PPISLVNLSTASSAP

−

−

−

−

26

QSAQPNAGDLRSQYQ

−

−

+

−

10

SPFCAKSPRYTLDSV

−

−

−

−

64

LVNLSTASSAPPTRV

−

−

+

−

27

PNAGDLRSQYQNLWL

−

+

−

−

11

AKSPRYTLDSVNGYP

−

−

−

−

65

STASSAPPTRVRR

−

−

−

−

  1. Italic indicates a common B cell epitope which was identified in four BLV experimentally infected Japanese Black cattle by peptide microarray
  2. + only positive response with BLV positive serum; − none response with serums
  3. aAntigens were derived from BLV Gag (p15, p24, and p12) and Env gp51 proteins
  4. bThese BLV positive serums were obtained from BLV-experimentally infected cattle as shown in Table 1