Wild-type proteases | |||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | CA | p2 | |||||||||||
Gag position | 359 | 360 | 361 | 362 | 363 | 364 | 365 | 366 | 367 | 368 | 369 | 370 | 371 |
HXB2 aa | K | A | R | V | L | A | E | A | M | S | Q | V | T |
WT HXB2 n = 10 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | - | A | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | V/I | - | - | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | V/I | - | A/V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
WT NL4-3 n = 10 | - | - | - | - | - | A/V | - | A/V | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | A/V | - | - | - | - | - | V/A | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | A/V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
NC/p1 431V n = 4 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
NC/p1 436E-437T n = 4 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | V/I | - | A/V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |
 | - | - | - | - | - | V | - | - | - | - | - | - | - |