TY - JOUR AU - Gulick, R. M. AU - Mellors, J. W. AU - Havlir, D. AU - Eron, J. J. AU - Gonzalez, C. AU - McMahon, D. AU - Richman, D. D. AU - Valentine, F. T. AU - Jonas, L. AU - Meibohm, A. AU - Emini, E. A. AU - Chodakewitz, J. A. PY - 1997 DA - 1997// TI - Treatment with indinavir, zidovudine, and lamivudine in adults with human immunodeficiency virus infection and prior antiretroviral therapy JO - N Engl J Med VL - 337 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM199709113371102 DO - 10.1056/NEJM199709113371102 ID - Gulick1997 ER - TY - JOUR AU - Hammer, S. M. AU - Squires, K. E. AU - Hughes, M. D. AU - Grimes, J. M. AU - Demeter, L. M. AU - Currier, J. S. AU - Eron, J. J. AU - Feinberg, J. E. AU - Balfour, H. H. AU - Deyton, L. R. AU - Chodakewitz, J. A. AU - Fischl, M. A. PY - 1997 DA - 1997// TI - A controlled trial of two nucleoside analogues plus indinavir in persons with human immunodeficiency virus infection and CD4 cell counts of 200 per cubic millimeter or less. AIDS Clinical Trials Group 320 Study Team JO - N Engl J Med VL - 337 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM199709113371101 DO - 10.1056/NEJM199709113371101 ID - Hammer1997 ER - TY - JOUR AU - Palella, F. J. AU - Delaney, K. M. AU - Moorman, A. C. AU - Loveless, M. O. AU - Fuhrer, J. AU - Satten, G. A. AU - Aschman, D. J. AU - Holmberg, S. D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Declining morbidity and mortality among patients with advanced human immunodeficiency virus infection. HIV Outpatient Study Investigators JO - N Engl J Med VL - 338 UR - https://doi.org/10.1056/NEJM199803263381301 DO - 10.1056/NEJM199803263381301 ID - Palella1998 ER - TY - JOUR AU - Detels, R. AU - Munoz, A. AU - McFarlane, G. AU - Kingsley, L. A. AU - Margolick, J. B. AU - Giorgi, J. AU - Schrager, L. K. AU - Phair, J. P. PY - 1998 DA - 1998// TI - Effectiveness of potent antiretroviral therapy on time to AIDS and death in men with known HIV infection duration. Multicenter AIDS Cohort Study Investigators JO - Jama VL - 280 UR - https://doi.org/10.1001/jama.280.17.1497 DO - 10.1001/jama.280.17.1497 ID - Detels1998 ER - TY - JOUR AU - Mocroft, A. AU - Vella, S. AU - Benfield, T. L. AU - Chiesi, A. AU - Miller, V. AU - Gargalianos, P. AU - d'Arminio Monforte, A. AU - Yust, I. AU - Bruun, J. N. AU - Phillips, A. N. AU - Lundgren, J. D. PY - 1998 DA - 1998// TI - Changing patterns of mortality across Europe in patients infected with HIV-1. EuroSIDA Study Group JO - Lancet VL - 352 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(98)03201-2 DO - 10.1016/S0140-6736(98)03201-2 ID - Mocroft1998 ER - TY - JOUR AU - Vittinghoff, E. AU - Scheer, S. AU - O'Malley, P. AU - Colfax, G. AU - Holmberg, S. D. AU - Buchbinder, S. P. PY - 1999 DA - 1999// TI - Combination antiretroviral therapy and recent declines in AIDS incidence and mortality JO - J Infect Dis VL - 179 UR - https://doi.org/10.1086/314623 DO - 10.1086/314623 ID - Vittinghoff1999 ER - TY - JOUR AU - Perelson, A. S. AU - Essunger, P. AU - Cao, Y. AU - Vesanen, M. AU - Hurley, A. AU - Saksela, K. AU - Markowitz, M. AU - Ho, D. D. PY - 1997 DA - 1997// TI - Decay characteristics of HIV-1-infected compartments during combination therapy JO - Nature VL - 387 UR - https://doi.org/10.1038/387188a0 DO - 10.1038/387188a0 ID - Perelson1997 ER - TY - JOUR AU - Chun, T. W. AU - Stuyver, L. AU - Mizell, S. B. AU - Ehler, L. A. AU - Mican, J. A. AU - Baseler, M. AU - Lloyd, A. L. AU - Nowak, M. A. AU - Fauci, A. S. PY - 1997 DA - 1997// TI - Presence of an inducible HIV-1 latent reservoir during highly active antiretroviral therapy JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 94 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.94.24.13193 DO - 10.1073/pnas.94.24.13193 ID - Chun1997 ER - TY - JOUR AU - Chun, T. W. AU - Fauci, A. S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Latent reservoirs of HIV: obstacles to the eradication of virus JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 96 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.96.20.10958 DO - 10.1073/pnas.96.20.10958 ID - Chun1999 ER - TY - JOUR AU - Finzi, D. AU - Hermankova, M. AU - Pierson, T. AU - Carruth, L. M. AU - Buck, C. AU - Chaisson, R. E. AU - Quinn, T. C. AU - Chadwick, K. AU - Margolick, J. AU - Brookmeyer, R. AU - Gallant, J. AU - Markowitz, M. AU - Ho, D. D. AU - Richman, D. D. AU - Siliciano, R. F. PY - 1997 DA - 1997// TI - Identification of a reservoir for HIV-1 in patients on highly active antiretroviral therapy JO - Science VL - 278 UR - https://doi.org/10.1126/science.278.5341.1295 DO - 10.1126/science.278.5341.1295 ID - Finzi1997 ER - TY - JOUR AU - Wong, J. K. AU - Hezareh, M. AU - Gunthard, H. F. AU - Havlir, D. V. AU - Ignacio, C. C. AU - Spina, C. A. AU - Richman, D. D. PY - 1997 DA - 1997// TI - Recovery of replication-competent HIV despite prolonged suppression of plasma viremia JO - Science VL - 278 UR - https://doi.org/10.1126/science.278.5341.1291 DO - 10.1126/science.278.5341.1291 ID - Wong1997 ER - TY - JOUR AU - Egger, G. AU - Liang, G. AU - Aparicio, A. AU - Jones, P. A. PY - 2004 DA - 2004// TI - Epigenetics in human disease and prospects for epigenetic therapy JO - Nature VL - 429 UR - https://doi.org/10.1038/nature02625 DO - 10.1038/nature02625 ID - Egger2004 ER - TY - JOUR AU - Ylisastigui, L. AU - Coull, J. J. AU - Rucker, V. C. AU - Melander, C. AU - Bosch, R. J. AU - Brodie, S. J. AU - Corey, L. AU - Sodora, D. L. AU - Dervan, P. B. AU - Margolis, D. M. PY - 2004 DA - 2004// TI - Polyamides reveal a role for repression in latency within resting T cells of HIV-infected donors JO - J Infect Dis VL - 190 UR - https://doi.org/10.1086/423822 DO - 10.1086/423822 ID - Ylisastigui2004 ER - TY - JOUR AU - Lehrman, G. AU - Hogue, I. B. AU - Palmer, S. AU - Jennings, C. AU - Spina, C. A. AU - Wiegand, A. AU - Landay, A. L. AU - Coombs, R. W. AU - Richman, D. D. AU - Mellors, J. W. AU - Coffin, J. M. AU - Bosch, R. J. AU - Margolis, D. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Depletion of latent HIV-1 infection in vivo: a proof-of-concept study JO - Lancet VL - 366 UR - https://doi.org/10.1016/S0140-6736(05)67098-5 DO - 10.1016/S0140-6736(05)67098-5 ID - Lehrman2005 ER - TY - JOUR AU - Smith, S. M. PY - 2005 DA - 2005// TI - Valproic acid and HIV-1 latency: beyond the sound bite JO - Retrovirology VL - 2 UR - https://doi.org/10.1186/1742-4690-2-56 DO - 10.1186/1742-4690-2-56 ID - Smith2005 ER - TY - JOUR AU - Harbers, K. AU - Schnieke, A. AU - Stuhlmann, H. AU - Jahner, D. AU - Jaenisch, R. PY - 1981 DA - 1981// TI - DNA methylation and gene expression: endogenous retroviral genome becomes infectious after molecular cloning JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 78 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.78.12.7609 DO - 10.1073/pnas.78.12.7609 ID - Harbers1981 ER - TY - JOUR AU - Hu, W. S. AU - Fanning, T. G. AU - Cardiff, R. D. PY - 1984 DA - 1984// TI - Mouse mammary tumor virus: specific methylation patterns of proviral DNA in normal mouse tissues JO - J Virol VL - 49 ID - Hu1984 ER - TY - JOUR AU - Li, E. AU - Beard, C. AU - Jaenisch, R. PY - 1993 DA - 1993// TI - Role for DNA methylation in genomic imprinting JO - Nature VL - 366 UR - https://doi.org/10.1038/366362a0 DO - 10.1038/366362a0 ID - Li1993 ER - TY - JOUR AU - Niwa, O. AU - Sugahara, T. PY - 1981 DA - 1981// TI - 5-Azacytidine induction of mouse endogenous type C virus and suppression of DNA methylation JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 78 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.78.10.6290 DO - 10.1073/pnas.78.10.6290 ID - Niwa1981 ER - TY - JOUR AU - Bednarik, D. P. AU - Mosca, J. D. AU - Raj, N. B. PY - 1987 DA - 1987// TI - Methylation as a modulator of expression of human immunodeficiency virus JO - J Virol VL - 61 ID - Bednarik1987 ER - TY - JOUR AU - Bednarik, D. P. AU - Cook, J. A. AU - Pitha, P. M. PY - 1990 DA - 1990// TI - Inactivation of the HIV LTR by DNA CpG methylation: evidence for a role in latency JO - Embo J VL - 9 ID - Bednarik1990 ER - TY - JOUR AU - Gutekunst, K. A. AU - Kashanchi, F. AU - Brady, J. N. AU - Bednarik, D. P. PY - 1993 DA - 1993// TI - Transcription of the HIV-1 LTR is regulated by the density of DNA CpG methylation JO - J Acquir Immune Defic Syndr VL - 6 ID - Gutekunst1993 ER - TY - JOUR AU - Schulze-Forster, K. AU - Gotz, F. AU - Wagner, H. AU - Kroger, H. AU - Simon, D. PY - 1990 DA - 1990// TI - Transcription of HIV1 is inhibited by DNA methylation JO - Biochem Biophys Res Commun VL - 168 UR - https://doi.org/10.1016/0006-291X(90)91685-L DO - 10.1016/0006-291X(90)91685-L ID - Schulze-Forster1990 ER - TY - JOUR AU - Folks, T. M. AU - Justement, J. AU - Kinter, A. AU - Dinarello, C. A. AU - Fauci, A. S. PY - 1987 DA - 1987// TI - Cytokine-induced expression of HIV-1 in a chronically infected promonocyte cell line JO - Science VL - 238 UR - https://doi.org/10.1126/science.3313729 DO - 10.1126/science.3313729 ID - Folks1987 ER - TY - JOUR AU - Folks, T. M. AU - Clouse, K. A. AU - Justement, J. AU - Rabson, A. AU - Duh, E. AU - Kehrl, J. H. AU - Fauci, A. S. PY - 1989 DA - 1989// TI - Tumor necrosis factor alpha induces expression of human immunodeficiency virus in a chronically infected T-cell clone JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 86 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.86.7.2365 DO - 10.1073/pnas.86.7.2365 ID - Folks1989 ER - TY - JOUR AU - Chun, T. W. AU - Engel, D. AU - Mizell, S. B. AU - Ehler, L. A. AU - Fauci, A. S. PY - 1998 DA - 1998// TI - Induction of HIV-1 replication in latently infected CD4+ T cells using a combination of cytokines JO - J Exp Med VL - 188 UR - https://doi.org/10.1084/jem.188.1.83 DO - 10.1084/jem.188.1.83 ID - Chun1998 ER - TY - JOUR AU - Chun, T. W. AU - Engel, D. AU - Mizell, S. B. AU - Hallahan, C. W. AU - Fischette, M. AU - Park, S. AU - Davey, R. T. AU - Dybul, M. AU - Kovacs, J. A. AU - Metcalf, J. A. AU - Mican, J. M. AU - Berrey, M. M. AU - Corey, L. AU - Lane, H. C. AU - Fauci, A. S. PY - 1999 DA - 1999// TI - Effect of interleukin-2 on the pool of latently infected, resting CD4+ T cells in HIV-1-infected patients receiving highly active anti-retroviral therapy JO - Nat Med VL - 5 UR - https://doi.org/10.1038/9498 DO - 10.1038/9498 ID - Chun1999 ER - TY - JOUR AU - Clark, S. J. AU - Harrison, J. AU - Paul, C. L. AU - Frommer, M. PY - 1994 DA - 1994// TI - High sensitivity mapping of methylated cytosines JO - Nucleic Acids Res VL - 22 UR - https://doi.org/10.1093/nar/22.15.2990 DO - 10.1093/nar/22.15.2990 ID - Clark1994 ER - TY - JOUR AU - Koiwa, T. AU - Hamano-Usami, A. AU - Ishida, T. AU - Okayama, A. AU - Yamaguchi, K. AU - Kamihira, S. AU - Watanabe, T. PY - 2002 DA - 2002// TI - 5'-long terminal repeat-selective CpG methylation of latent human T-cell leukemia virus type 1 provirus in vitro and in vivo JO - J Virol VL - 76 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.76.18.9389-9397.2002 DO - 10.1128/JVI.76.18.9389-9397.2002 ID - Koiwa2002 ER - TY - JOUR AU - Tanaka, J. AU - Ishida, T. AU - Choi, B. I. AU - Yasuda, J. AU - Watanabe, T. AU - Iwakura, Y. PY - 2003 DA - 2003// TI - Latent HIV-1 reactivation in transgenic mice requires cell cycle -dependent demethylation of CREB/ATF sites in the LTR JO - Aids VL - 17 UR - https://doi.org/10.1097/00002030-200301240-00005 DO - 10.1097/00002030-200301240-00005 ID - Tanaka2003 ER - TY - JOUR AU - Poli, G. AU - Kinter, A. AU - Justement, J. S. AU - Kehrl, J. H. AU - Bressler, P. AU - Stanley, S. AU - Fauci, A. S. PY - 1990 DA - 1990// TI - Tumor necrosis factor alpha functions in an autocrine manner in the induction of human immunodeficiency virus expression JO - Proc Natl Acad Sci U S A VL - 87 UR - https://doi.org/10.1073/pnas.87.2.782 DO - 10.1073/pnas.87.2.782 ID - Poli1990 ER - TY - JOUR AU - Boyes, J. AU - Bird, A. PY - 1992 DA - 1992// TI - Repression of genes by DNA methylation depends on CpG density and promoter strength: evidence for involvement of a methyl-CpG binding protein JO - Embo J VL - 11 ID - Boyes1992 ER - TY - JOUR AU - Hsieh, C. L. PY - 1994 DA - 1994// TI - Dependence of transcriptional repression on CpG methylation density JO - Mol Cell Biol VL - 14 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.14.8.5487 DO - 10.1128/MCB.14.8.5487 ID - Hsieh1994 ER - TY - JOUR AU - Iannello, R. C. AU - Young, J. AU - Sumarsono, S. AU - Tymms, M. J. AU - Dahl, H. H. AU - Gould, J. AU - Hedger, M. AU - Kola, I. PY - 1997 DA - 1997// TI - Regulation of Pdha-2 expression is mediated by proximal promoter sequences and CpG methylation JO - Mol Cell Biol VL - 17 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.17.2.612 DO - 10.1128/MCB.17.2.612 ID - Iannello1997 ER - TY - JOUR AU - Jansson, A. AU - Masucci, M. AU - Rymo, L. PY - 1992 DA - 1992// TI - Methylation of discrete sites within the enhancer region regulates the activity of the Epstein-Barr virus BamHI W promoter in Burkitt lymphoma lines JO - J Virol VL - 66 ID - Jansson1992 ER - TY - JOUR AU - Mancini, D. N. AU - Rodenhiser, D. I. AU - Ainsworth, P. J. AU - O'Malley, F. P. AU - Singh, S. M. AU - Xing, W. AU - Archer, T. K. PY - 1998 DA - 1998// TI - CpG methylation within the 5' regulatory region of the BRCA1 gene is tumor specific and includes a putative CREB binding site JO - Oncogene VL - 16 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1201630 DO - 10.1038/sj.onc.1201630 ID - Mancini1998 ER - TY - JOUR AU - Mancini, D. N. AU - Singh, S. M. AU - Archer, T. K. AU - Rodenhiser, D. I. PY - 1999 DA - 1999// TI - Site-specific DNA methylation in the neurofibromatosis (NF1) promoter interferes with binding of CREB and SP1 transcription factors JO - Oncogene VL - 18 UR - https://doi.org/10.1038/sj.onc.1202764 DO - 10.1038/sj.onc.1202764 ID - Mancini1999 ER - TY - JOUR AU - Robertson, K. D. AU - Hayward, S. D. AU - Ling, P. D. AU - Samid, D. AU - Ambinder, R. F. PY - 1995 DA - 1995// TI - Transcriptional activation of the Epstein-Barr virus latency C promoter after 5-azacytidine treatment: evidence that demethylation at a single CpG site is crucial JO - Mol Cell Biol VL - 15 UR - https://doi.org/10.1128/MCB.15.11.6150 DO - 10.1128/MCB.15.11.6150 ID - Robertson1995 ER - TY - JOUR AU - Richards, E. J. AU - Elgin, S. C. PY - 2002 DA - 2002// TI - Epigenetic codes for heterochromatin formation and silencing: rounding up the usual suspects JO - Cell VL - 108 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(02)00644-X DO - 10.1016/S0092-8674(02)00644-X ID - Richards2002 ER - TY - JOUR AU - O'Brien, M. C. AU - Ueno, T. AU - Jahan, N. AU - Zajac-Kaye, M. AU - Mitsuya, H. PY - 1995 DA - 1995// TI - HIV-1 expression induced by anti-cancer agents in latently HIV-1-infected ACH2 cells JO - Biochem Biophys Res Commun VL - 207 UR - https://doi.org/10.1006/bbrc.1995.1271 DO - 10.1006/bbrc.1995.1271 ID - O'Brien1995 ER - TY - JOUR AU - Singh, M. K. AU - Pauza, C. D. PY - 1992 DA - 1992// TI - Extrachromosomal human immunodeficiency virus type 1 sequences are methylated in latently infected U937 cells JO - Virology VL - 188 UR - https://doi.org/10.1016/0042-6822(92)90498-E DO - 10.1016/0042-6822(92)90498-E ID - Singh1992 ER - TY - JOUR AU - Pion, M. AU - Jordan, A. AU - Biancotto, A. AU - Dequiedt, F. AU - Gondois-Rey, F. AU - Rondeau, S. AU - Vigne, R. AU - Hejnar, J. AU - Verdin, E. AU - Hirsch, I. PY - 2003 DA - 2003// TI - Transcriptional suppression of in vitro-integrated human immunodeficiency virus type 1 does not correlate with proviral DNA methylation JO - J Virol VL - 77 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.77.7.4025-4032.2003 DO - 10.1128/JVI.77.7.4025-4032.2003 ID - Pion2003 ER -